企業(yè)戰(zhàn)略聯(lián)盟的主要類型包括合資企業(yè)、相互持股投資和功能性協(xié)議。功能性協(xié)議是一種契約式的戰(zhàn)略聯(lián)盟，與前面兩種涉及股權參與的方式明顯不同，有人稱之為無資產(chǎn)性投資的戰(zhàn)略聯(lián)盟。它主要是指企業(yè)之間決定在某些具體的領域進行合作。比如，在聯(lián)合研究與開發(fā)、聯(lián)合市場行動等方面通過功能性協(xié)議結成一種聯(lián)盟。本題中的甲公司與美心面粉廠簽訂合作協(xié)議，屬于契約式戰(zhàn)略聯(lián)盟中的功能性協(xié)議，選項C正確。