近年來，由運(yùn)輸費(fèi)用引發(fā)偷逃增值稅、企業(yè)所得稅現(xiàn)象也不斷發(fā)生。稅務(wù)部門在檢查中發(fā)現(xiàn)，受票企業(yè)通過接受虛開的運(yùn)輸發(fā)票騙抵增值稅進(jìn)項(xiàng)稅款是交通運(yùn)輸企業(yè)虛構(gòu)運(yùn)輸業(yè)務(wù)違法開具發(fā)票的主要原因。造成這一現(xiàn)象的發(fā)生，歸結(jié)起來這有兩方面原因。在政策方面，由于運(yùn)輸企業(yè)開具運(yùn)輸發(fā)票營業(yè)稅金為3%(不考慮所得稅)而在受票方可按7%抵扣增值稅;體制方面，運(yùn)輸企業(yè)營業(yè)稅及運(yùn)輸發(fā)票由地稅部門負(fù)責(zé)管理，而可抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅由國稅部門進(jìn)行管理，這很容易造成同一發(fā)票的管理脫節(jié)，形成管理真空。因此，2010年國家稅務(wù)總局將交通運(yùn)輸企業(yè)列入了專項(xiàng)檢查的重點(diǎn)。

　　《中華人民共和國增值稅暫行條例》規(guī)定，“購進(jìn)或者銷售貨物以及在生產(chǎn)經(jīng)營過程中對所支付運(yùn)輸費(fèi)用，按照運(yùn)輸費(fèi)用結(jié)算單據(jù)上注明的運(yùn)輸費(fèi)用金額和7%的扣除率計(jì)算的進(jìn)項(xiàng)稅額�！庇捎谶\(yùn)輸發(fā)票是增值稅進(jìn)項(xiàng)稅的重要抵扣憑證，因此，企業(yè)在運(yùn)用運(yùn)輸發(fā)票進(jìn)行抵扣時(shí)，應(yīng)注意從以下四個(gè)方面來防范稅收風(fēng)險(xiǎn)。

　　(一)要審查取得票種及開具內(nèi)容的合法有效性

　　《國家稅務(wù)總局關(guān)于公路內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票增值稅抵扣有關(guān)問題的公告》(國家稅務(wù)總局公告[2006]2號)規(guī)定，自2007年1月1日起，增值稅一般納稅人購進(jìn)或銷售貨物，取得的作為增值稅扣稅憑證的貨運(yùn)發(fā)票，必須是通過貨運(yùn)發(fā)票稅控系統(tǒng)開具的新版貨運(yùn)發(fā)票。否則不能作為增值稅扣稅憑證抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。企業(yè)在取得運(yùn)輸發(fā)票時(shí)，要審查發(fā)票的填寫內(nèi)容的合法準(zhǔn)確性。即按規(guī)定自開票納稅人和代開票單位必須按照規(guī)定逐欄、如實(shí)填開貨物運(yùn)輸業(yè)發(fā)票，必須填寫該增值稅一般納稅人的名稱和納稅人識別號。貨運(yùn)發(fā)票的發(fā)貨人、收貨人、起止地、運(yùn)輸方式、貨物名稱、數(shù)量單價(jià)、運(yùn)輸金額必須填寫齊全，并與購銷貨發(fā)票所列的有關(guān)內(nèi)容相符，運(yùn)輸發(fā)票支付貨款單位必須與抵扣憑證的銷貨單位或者提供勞務(wù)單位一致。

　　因此，取得運(yùn)輸發(fā)票單位如相關(guān)信息不符合上述規(guī)定，計(jì)算的增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額不能抵扣。

　　(二)要注意申報(bào)抵扣的時(shí)間規(guī)定

　　運(yùn)輸發(fā)票申報(bào)抵扣應(yīng)關(guān)注《國家稅務(wù)總局關(guān)于調(diào)整增值稅扣稅憑證抵扣期限有關(guān)問題的通知》(國稅函[2009]617號)第一條規(guī)定：增值稅一般納稅人取得2010年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、道路內(nèi)河貨物運(yùn)輸業(yè)統(tǒng)一發(fā)票和機(jī)動(dòng)車銷售統(tǒng)一發(fā)票應(yīng)在開具之日起180日內(nèi)到稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理認(rèn)證，并在認(rèn)證通過的次月申報(bào)期內(nèi)，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。

　　(三)申報(bào)抵扣時(shí)要報(bào)送《增值稅運(yùn)輸發(fā)票抵扣清單》紙質(zhì)資料及電子信息

　　增值稅一般納稅人取得的所有需計(jì)算抵扣增值稅進(jìn)項(xiàng)稅額的運(yùn)輸發(fā)票，應(yīng)根據(jù)相關(guān)運(yùn)輸發(fā)票逐票填寫并報(bào)送《增值稅運(yùn)輸發(fā)票抵扣清單》(還需同時(shí)報(bào)送電子信息)，必須填寫其中的“取得運(yùn)輸發(fā)票單位名稱及識別號”欄，否則，所取得的運(yùn)費(fèi)發(fā)票不能作為增值稅進(jìn)項(xiàng)抵扣憑證;未單獨(dú)報(bào)送《增值稅運(yùn)輸發(fā)票抵扣清單》紙質(zhì)資料及電子信息的，其運(yùn)輸發(fā)票進(jìn)項(xiàng)稅額不得抵扣;未按規(guī)定要求填寫《增值稅運(yùn)輸發(fā)票抵扣清單》或者填寫內(nèi)容不全的，該張運(yùn)輸發(fā)票就不能計(jì)算抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。但2007年4月1日起，取得運(yùn)輸發(fā)票需要通過認(rèn)證后可以抵扣。

　　(四)不能擅自擴(kuò)大抵扣金額

　　根據(jù)稅法的規(guī)定，準(zhǔn)予抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額的運(yùn)輸費(fèi)用，是指運(yùn)輸單位開具的發(fā)票上注明的運(yùn)費(fèi)、建設(shè)基金，但不包括隨同運(yùn)費(fèi)支付裝御費(fèi)、保險(xiǎn)費(fèi)等其它雜費(fèi)。

　　有些企業(yè)將購進(jìn)固定資產(chǎn)支付的運(yùn)費(fèi)列入進(jìn)項(xiàng)稅進(jìn)行抵扣;向非一般納稅人購進(jìn)貨物，因無法取得增值稅專用發(fā)票抵扣稅款，由購貨方將購物的貨款以運(yùn)輸發(fā)票充數(shù)，按照7%抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額;購進(jìn)或者銷售免稅貨物所發(fā)生的運(yùn)輸費(fèi)用，作為進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣;購貨單位詳細(xì)運(yùn)輸記錄中的裝卸、吊裝、倉儲、清理等雜費(fèi)也混入運(yùn)輸費(fèi)中。

　　當(dāng)稅務(wù)機(jī)關(guān)質(zhì)疑受票單位運(yùn)輸業(yè)務(wù)真實(shí)性或稅務(wù)檢查機(jī)關(guān)發(fā)現(xiàn)開票單位存在虛擬運(yùn)輸業(yè)務(wù)時(shí)，將通過對購貨和運(yùn)輸單位對應(yīng)的物流、票流、資金流方面進(jìn)行核查，對企業(yè)的供應(yīng)、財(cái)務(wù)部門、運(yùn)輸部門分別調(diào)查，結(jié)合材料采購、貨物運(yùn)輸、資金支付以及財(cái)務(wù)處理進(jìn)行多方位查證，加以相互印證。其虛開運(yùn)輸發(fā)票事實(shí)會暴露出來，受到應(yīng)有的處罰。