在明確了“會計電算化”的目標是對傳統(tǒng)會計進行改造以后建立的一個新的電算化會計信息系統(tǒng)之后，當前我國會計電算化工作應(yīng)該特別注意處理好三個關(guān)系。

    正確處理財務(wù)會計電算化與管理會計電算化的關(guān)系。目前，我國會計電算化還處于會計核算電算化的水平，或者說，現(xiàn)在僅僅實現(xiàn)了財務(wù)會計的電算化。財務(wù)會計電算化還不是完整意義的會計電算化。因為，企業(yè)會計包括財務(wù)會計和成本與管理會計兩大分支。所以，完整意義的會計電算化應(yīng)該是財務(wù)會計和管理會計的全面電算化。我們不能因為目前管理會計在企業(yè)應(yīng)用還不普及或者有困難而停止不前。我們認為，管理會計在企業(yè)推廣困難的原因盡管很多，但重要原因之一是其規(guī)范性和可操作性不如財務(wù)會計以及財務(wù)會計與成本管理會計的分離。因此，管理會計軟件商品化通用化比較困難，只能有針對性地開發(fā)研究。但是，管理會計電算化是以財務(wù)會計電算化為基礎(chǔ)的，因為它們的數(shù)據(jù)同源，財務(wù)會計電算化能為管理會計電算化提供所需的財會信息。因此，企業(yè)應(yīng)在實現(xiàn)財務(wù)會計電算化的基礎(chǔ)上不失時機地推進管理會計電算化，解決管理會計手工操作難的問題，這里應(yīng)特別強調(diào)會計電算化不是簡單的財務(wù)會計電算化加管理會計電算化，而應(yīng)該是財務(wù)會計與管理會計結(jié)合后的電算化，這樣才能促進管理會計在企業(yè)中的推廣應(yīng)用，真正實現(xiàn)會計的核算職能、管理職能和控制職能。

    正確處理會計電算化與企業(yè)管理信息系統(tǒng)之間的關(guān)系企業(yè)管理信息系統(tǒng)（MIS）是一個為企業(yè)管理決策服務(wù)的人、機系統(tǒng)。它通過對企業(yè)內(nèi)部和外部的數(shù)據(jù)進行處理獲取信息，控制企業(yè)的行為；利用已知的數(shù)據(jù)和模型對未來作出預(yù)測；從企業(yè)全局出發(fā)，對管理決策提供參考信息。企業(yè)管理信息系統(tǒng)按管理職能一般劃分為會計管理、人事管理、市場營銷、計劃管理、生產(chǎn)管理、庫存管理、技術(shù)管理等子系統(tǒng)。各子系統(tǒng)擔負著不同的任務(wù)，起著不同的作用。其中會計管理子系統(tǒng)（即電算化會計子系統(tǒng)）是最重要的子系統(tǒng)，處于核心地位。這是因為會計管理子系統(tǒng)與企業(yè)管理信息系統(tǒng)之間存在如下關(guān)系：

    電算化會計子系統(tǒng)是開發(fā)企業(yè)管理信息系統(tǒng)的基礎(chǔ)。因為會計信息全面反映了企業(yè)銷、供、產(chǎn)日常生產(chǎn)經(jīng)營流程的各個環(huán)節(jié)，完整地反映了企業(yè)管理的全過程。沒有哪個子系統(tǒng)的管理信息像會計信息那樣自始至終貫穿于企業(yè)的管理活動之中，幾乎與其他所有子系統(tǒng)都有數(shù)據(jù)聯(lián)系。因此，企業(yè)管理現(xiàn)代化一般都從會計電算化開始，在此基礎(chǔ)上再逐步擴大功能，最終實現(xiàn)企業(yè)管理信息系統(tǒng)，

    促使會計電算化向更高層次發(fā)展是建立企業(yè)管理信息系統(tǒng)的前提。我國會計電算化的當務(wù)之急是加強會計電算化發(fā)展方向的引導，促進會計電算化從核算型向管理型過渡；重視會計電算化軟件開發(fā)和二次開發(fā)；引導會計電算化由單機向網(wǎng)絡(luò)化和客戶／服務(wù)器方向發(fā)展。只有這樣，企業(yè)管理信息系統(tǒng)才具備開發(fā)的良好基礎(chǔ)。

    企業(yè)管理信息系統(tǒng)是會計電算化發(fā)展的系統(tǒng)目標和客觀生存環(huán)境。脫離企業(yè)管理這個系統(tǒng)目標，會計電算化的研究就會迷失方向，無所適從。會計電算化的研究應(yīng)站在整個企業(yè)管理信息系統(tǒng)的立場上，從整個企業(yè)的角度發(fā)揮計算機在管理中的應(yīng)用，努力實現(xiàn)“管理一體化”。或者說，會計電算化與企業(yè)管理信息系統(tǒng)的目標是一致的。會計電算化只有充分參與企業(yè)管理信息系統(tǒng)的工作才有生命力。因為企業(yè)管理信息系統(tǒng)為會計電算化提供研究課題，并不斷豐富會計電算化的內(nèi)容從而推動會計電算化的發(fā)展。正確處理好會計電算化和企業(yè)管理信息系統(tǒng)的關(guān)系，實現(xiàn)會計電算化和企業(yè)管理信息系統(tǒng)的共同目標，要求我們把會計電算化系統(tǒng)作為企業(yè)MIS的一個子系統(tǒng)來開發(fā)，開發(fā)時又要充分考慮到它是企業(yè)MIS的一個獨立的起核心作用的子系統(tǒng)。

    正確處理好會計電算化與審計的關(guān)系會計電算化是對傳統(tǒng)手工會計進行了改造和革新后產(chǎn)生的，它將在企業(yè)現(xiàn)代化管理中扮演重要角色。會計電算化信息系統(tǒng)的誕生不僅給傳統(tǒng)會計帶來革新而且也給傳統(tǒng)審計帶來巨大沖擊。主要表現(xiàn)在：

    會計電算化后，傳統(tǒng)審計線索變化了而且計算過程也不直觀了。因為電算化會計的手工明細賬、日記賬不存在了，記賬憑證數(shù)據(jù)存儲在磁性介質(zhì)上。財務(wù)處理過程在計算機內(nèi)自動完成，肉眼可見的審計線索大大減少，過去對證賬、賬賬核對的辦法現(xiàn)在不方便了，這無疑給審計工作者帶來了困難。

    會計電算化后，過去的內(nèi)部管理制度也不適用了。靠人為的分工來監(jiān)督很困難。因為電算化系統(tǒng)除憑證輸入目前需要由人工完成外，其余處理全由計算機完成，人工干預(yù)越來越少，而且數(shù)據(jù)的輸入、存儲和修改都不留痕跡。所以，手工會計使用的內(nèi)部控制方法失去了作用。這一點是對審計人員提出的嚴重挑戰(zhàn)。

    電算化會計系統(tǒng)本身的故障也會給審計工作帶來困難。例如，不可預(yù)計的環(huán)境災(zāi)害、硬件設(shè)備或軟件的失靈、人為無意的差錯和有意的舞弊等都可能給系統(tǒng)造成無法估計的危害。因此，會計電算化能給企業(yè)帶來巨大效益的同時，也存在可能帶來巨大的風險。為了盡可能減少風險，尤其是打擊計算機舞弊，我們再不能重犯發(fā)達國家過去先研究電算化會計再研究電算化審計而造成巨大損失的錯誤。我們應(yīng)該在研究開發(fā)電算化會計信息系統(tǒng)的同時重視研究電算化審計的工作，使二者相互配合相互促進。為此，當前在研究電算化會計系統(tǒng)時，要注意研究現(xiàn)代審計的要求，使會計軟件盡可能滿足審計的要求，以減少系統(tǒng)的風險。

    現(xiàn)代審計活動一般分為查詢審核、證實存在和系統(tǒng)分析三個階段⑤。在查詢審核階段，電算化會計應(yīng)能為審計提供新的查詢線索。因此，電算化會計軟件應(yīng)提供關(guān)于“憑證－總賬－報表”三者之間的雙向查詢功能。在證實存在階段，電算化會計系統(tǒng)應(yīng)提供多種會計核算方法處理過程供用戶和審計員選擇，并編寫一套審計測試預(yù)留通道。系統(tǒng)分析階段是現(xiàn)代審計重要的過程。系統(tǒng)分析過程的重點是加強電算化會計系統(tǒng)的內(nèi)部控制。美國注冊會計師協(xié)會在第3號《審計準則公告》中將電算化會計系統(tǒng)的內(nèi)部控制分為一般控制和應(yīng)用控制兩類。一般控制是指對會計電算化過程的組織、電算化會計系統(tǒng)的研制開發(fā)及應(yīng)用環(huán)境等方面進行的控制。而應(yīng)用控制是為適應(yīng)各種會計處理的特殊要求而建立的能預(yù)防、檢測和更正錯誤、處理舞弊行為的控制措施。因此，應(yīng)用控制與會計軟件開發(fā)密切相關(guān)，應(yīng)特別引起重視。應(yīng)用控制一般分為初始化與維護控制、輸入控制、處理控制和輸出控制。

    初始化與維護控制。初始化工作主要指為保證系統(tǒng)正常運行而進行的準備工作。如設(shè)置系統(tǒng)初始時間、明細科目、口令、余額初始化及各種參數(shù)和文件的設(shè)置等。初始化工作是后續(xù)工作的基礎(chǔ)，因此會計軟件必須重視初始化工作的控制。維護工作主要指對系統(tǒng)數(shù)據(jù)的備份和恢復。它是保證系統(tǒng)安全正確運行的重要措施。

    輸入控制。輸入控制是應(yīng)用控制的重點。輸入控制就是在保證原始數(shù)據(jù)真實、準確的前提下，采取措施保證會計數(shù)據(jù)在編碼、填制記賬憑證及輸入過程中能及時發(fā)現(xiàn)可能出現(xiàn)的差錯并糾正。輸入控制的措施除了要不斷加強操作人員的責任心和提高技術(shù)水平外，還要采取如下控制方法：（1）建立科目對照檢查；（2）借、貸平衡檢查；（3）邏輯性檢查；（4）人工檢查。

    處理控制。處理控制的目的是保證處理步驟的正確性、可靠性和適應(yīng)性。因此，電算化會計系統(tǒng)應(yīng)具備處理過程的時序控制。例如，成本核算的時序控制及打印報表前的過賬和結(jié)賬時序控制等。由于審計人員不能觀察到有關(guān)數(shù)據(jù)的處理過程，所以，對處理控制應(yīng)特別關(guān)注。

    輸出控制。輸出控制的目的是保證輸出信息的準確、可靠。輸出控制必須做到的措施有打印日志控制、打印預(yù)覽控制、打印時間及序號控制等。