企業(yè)長期股權(quán)投資的計稅成本應(yīng)當以為取得該項投資所付出的全部代價確定。全部代價包括現(xiàn)金、非現(xiàn)金資產(chǎn)公允價、所承擔債務(wù)的公允價、所發(fā)行權(quán)益性證券的公允價，以及支付的相關(guān)稅費（不含企業(yè)所得稅），但不包括應(yīng)自被投資單位收取的已宣告但尚未發(fā)放的現(xiàn)金股利或利潤。由此可見，非同一控制下控股合并取得的長期股權(quán)投資的計稅成本與會計成本基本相同。主要差異有：

　　1.非同一控制下企業(yè)合并發(fā)生的各項直接相關(guān)費用（資產(chǎn)評估費等）計入投資成本，稅法規(guī)定，企業(yè)實際發(fā)生的咨詢費、評估費等在發(fā)生的當期據(jù)實申報扣除。

　　2.通過多次交易分步實現(xiàn)的控股合并，長期股權(quán)投資的會計成本按上述規(guī)定處理，其計稅成本為各次計稅成本之和。被投資方用留存收益轉(zhuǎn)增資本，視同投資方追加投資，也應(yīng)計入計稅成本處理。

　　3.財稅〔1994〕83號規(guī)定，由于外商投資企業(yè)從其境內(nèi)投資的企業(yè)取得的利潤（股息），不計入本企業(yè)應(yīng)納稅所得額，因此與該投資有關(guān)的可行性研究費用、投資貸款利息支出、投資管理費用等投資決策實施中的各項費用，不得沖減本企業(yè)應(yīng)納稅所得額。根據(jù)該項規(guī)定，計入當期損益的投資費用，不得在稅前扣除，應(yīng)作納稅調(diào)增處理。這部分投資費用應(yīng)當計入長期股權(quán)投資的計稅成本，在處置該項股權(quán)時，一并扣除。

　　4.作為對價的存貨已計提減值準備的，本期結(jié)轉(zhuǎn)的存貨跌價準備應(yīng)當調(diào)減所得。

　　5.作為對價的固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)已計提減值準備的，在視同銷售計算資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓所得時，允許扣除的成本為剩余計稅成本。剩余計稅成本=固定資產(chǎn)、無形資產(chǎn)初始計稅成本-已扣除的折舊額、攤銷額。

　　例：A公司于20×5年3月以4000萬元取得B公司30%的股權(quán)，因能夠派人參與B公司的生產(chǎn)經(jīng)營決策，對所取得的長期股權(quán)投資按照權(quán)益法核算并于20×5年確認對B公司的投資收益150萬元(該項投資的初始投資成本與投資時應(yīng)享有被投資單位可辨認凈資產(chǎn)公允價值的份額相等)。20×6年4月，A公司又出資5000萬元取得B公司另外30%的股權(quán)。假定A公司在取得對B公司的長期股權(quán)投資以后，B公司并未宣告發(fā)放現(xiàn)金股利或利潤；A公司按凈利潤的10%計提盈余公積。

　　本例中A公司是通過分步購買最終取得對B公司的控制權(quán)，形成企業(yè)合并。在購買日，A公司應(yīng)進行以下賬務(wù)處理：

　　借：盈余公積　　150000

　　　　利潤分配——未分配利潤　　1350000

　　　貸：長期股權(quán)投資　　l500000

　　借：長期股權(quán)投資　　50000000

　　　貸：銀行存款　　50000000

　　稅務(wù)處理：A公司取得該項投資的計稅成本為首次出資計稅成本與追加投資計稅成本之和9000萬元。本例會計成本與計稅成本相同。

　　需要注意的是，如果首次投資是以成本法核算（對被投資單位不具有控制、共同控制或重大影響，并且在活躍市場中沒有報價、公允價值不能可靠計量的權(quán)益性投資），并且是非現(xiàn)金資產(chǎn)交換方式取得，而且按成本模式計量，那么，其首次投資的會計成本與計稅成本會存在差異，從而導(dǎo)致累計計稅成本與會計成本之間存在差異。