正確答案：A,D,E

答案分析：（1）選項(xiàng)A：一般納稅人跨縣（市、區(qū)）提供建筑服務(wù)，適用一般計(jì)稅方法計(jì)稅的，以取得的全部?jī)r(jià)款和價(jià)外費(fèi)用扣除支付的分包款后的余額，按照2%的預(yù)征率計(jì)算應(yīng)預(yù)繳稅款。
甲公司在A省應(yīng)預(yù)繳的增值稅=（3000-200）÷（1+9%）×2%=51.38（萬(wàn)元）。
（2）選項(xiàng)B：甲公司在A省應(yīng)繳納的城市維護(hù)建設(shè)稅=51.38×5%=2.57（萬(wàn)元）。
（3）選項(xiàng)C：建筑企業(yè)與發(fā)包方簽訂建筑合同后，以?xún)?nèi)部授權(quán)或者三方協(xié)議等方式，授權(quán)集團(tuán)內(nèi)其他納稅人（第三方）為發(fā)包方提供建筑服務(wù)，并由第三方直接與發(fā)包方結(jié)算工程款的，由第三方繳納增值稅并向發(fā)包方開(kāi)具增值稅發(fā)票，與發(fā)包方簽訂建筑合同的建筑企業(yè)不繳納增值稅。發(fā)包方可憑實(shí)際提供建筑服務(wù)的納稅人開(kāi)具的增值稅專(zhuān)用發(fā)票抵扣進(jìn)項(xiàng)稅額。
（4）選項(xiàng)D：業(yè)務(wù)（2）可抵扣的進(jìn)項(xiàng)稅額=200÷（1+1%）×1%=1.98（萬(wàn)元）。
（5）選項(xiàng)E：業(yè)務(wù)（2）確認(rèn)的銷(xiāo)項(xiàng)稅額=3000÷（1+9%）×9%=247.71（萬(wàn)元）。